رغم تفريق علماء الإسلام بين الخلاف العلمي داخل حلقات الدرس وبين الإقصاء والتكفير والهجر؛ فإن تاريخ المسلمين شهد الكثير من حالات الخروج على هذه الضوابط بدوافع التعصب أو التمصلح.